Bem-vindos ao nosso Workshop!

Sejam bem-vindos ao nosso workshop Noções básicas em softwares para filogenia molecular: do acesso ao GenBank à construção da hipótese filogenética. A sistemática filogenética é uma disciplina central nas Ciências Biológicas e a modernização dos computadores e algoritmos proporcionou uma revolução nos métodos utilizados em filogenia. Pensando nisso, este minicurso tem por objetivo familiarizar os alunos com alguns dos softwares mais utilizados em filogenia molecular, desde a aquisição de sequências em repositórios públicos até a construção das árvores filogenéticas.

Pré-requisitos

Noções básicas de sistemática. Como o minicurso visa a familiarização com os softwares, o mesmo não abordará a teoria dos métodos detalhadamente.

Edições passadas

15 e 16 de dezembro de 2018 - V Simpósio de Zoologia Sistemática (curso completo - 12h)
22 de julho de 2019 - IX Congresso Brasileiro de Herpetologia (versão reduzida - 7h) 29 de janeiro de 2020 - Curso de Verão em Sistemática Zoológica da UFMG (curso teórico adaptado - um dia de aula)

Tutoriais de aula

Metodologia da Sistemática Filogenética (UFMG) - primeiro semestre de 2021

Material a ser levado pelos alunos

Notebook com os programas a serem utilizados previamente instalados, listados na página de cada curso. Lembre-se de baixar as versões de acordo com o seu sistema operacional! Em todo caso, é MUITO IMPORTANTE que vocês tenham o java e o python 2.7. Devido a algumas bibliotecas que vamos precisar, a melhor e mais fácil maneira de instalar este python é instalar o programa Anaconda. Não é o python 3, tem que ser o python 2!!!

Instrutores

Parcerias

Cique nos links no quadro abaixo para ver o conteúdo das aulas:

-Introdução
-Aquisição de sequências do GenBank
-Alinhamento
-Concatenamento
-Particionando a Matriz e escolhendo o modelo molecular que mais se encaixa nos dados
-Construindo a árvore utilizando o critério da máxima parcimônia
-Construindo a árvore utilizando o critério da máxima verossimilhança
-Construindo a árvore utilizando inferência Bayesiana

Agradecimentos

Agradecemos ao RADCamp e seus instrutores, que inspiraram totalmente o formato desse curso e desse site!