Bem-vindos à nossa parte do Curso de Verão em Sistemática Zoológica!
Este site foi feito com base em cursos que eu já venho dando em outras ocasiões e a ideia é que vocês façam a parte prática em casa para fxarem o conteúdo. Todas as práticas serão passadas em sala de aula e, qualquer dúvida que tenham em casa, podem entrar em contato conosco (Pedro Taucce e Rachel Montesinos).
Quando e onde?
29 de janeiro de 2020
Curso de Verão em Sistemática Zoológica da UFMG, Belo Horizonte - MG
Programas que serão utilizados no tutorial
Notebook com os programas a serem utilizados previamente instalados (a seguir). Lembre-se de baixar a versão de acordo com o seu sistema operacional!
- R
- R Studio (necessita do R previamente instalado)
- Mega software
- MAFFT 7
- Mesquite
- PartitionFinder2
- MrBayes 3.2
- FigTree
MUITO IMPORTANTE é que vocês tenham o java e o python 2.7 (a maneira mais fácil de instalar este python é instalar o programa Anaconda). Não é o python 3, tem que ser o python 2!!!
Instrutores
Horário
Cique nos links no quadro abaixo para ver os tutoriais a serem utilizados:
| Horário | Aula | Conteúdo |
|---|---|---|
| 08:30 10:00 |
- Caracteres morfológicos | - Introdução ao software Mesquite |
| 10:30 12:00 |
- Caracteres moleculares | - Apresentação da plataforma e aquisição de sequências do GenBank - Alinhamento - Concatenamento |
| 14:00 15:30 |
- Critérios de otimalidade: máxima parcimônia | - Introdução ao software TNT |
| 16:00 18:00 |
- Seleção de modelos - Critérios de otimalidade: máxima verossimilhança e inferência Bayesiana |
- Seleçao do melhor modelo de substituição nucleotídica - Introdução ao programa RAxML - Introdução ao programa MrBayes |
Agradecimentos
Agradecemos à organização do Curso de Verão em Sistemática Zoológica por nos proporcionar lecionar essa parte do curso.